Ancien élève de l'ENS (Ulm), agrégé de lettres classiques, titulaire d'un DEA d'histoire contemporaine, Michel Kérautret enseigne d'abord au lycée français de Berlin, où il découvre la culture allemande. À partir de 1978, il quitte l'enseignement pour l'Assemblée nationale.
Michel Kérautret a toujours porté un intérêt particulier à l'histoire napoléonienne. Auditeur des séminaires de Jean Tulard et de François Crouzet à l'École Pratique des Hautes Études et à la Sorbonne, c'est sa rencontre avec Roger Dufraisse (1922-2000), spécialiste de l'Allemagne napoléonienne, qui détermine son engagement personnel comme historien.
Ses travaux concernent surtout le domaine de l'histoire des relations internationales et celui de l'histoire de la Prusse.