Après un doctorat en mathématiques et informatique en 1965, Jacques André entre au CNRS dans une équipe de linguistique.
Après quelques années dans un centre de recherche et développement d'une société américaine, il intègre l'Institut de recherche en informatique et automatique (INRIA).
Il s’intéresse très vite à la typographie numérique et à la gestion des documents numériques. II crée et dirige pendant quatre ans le projet européen Didot d'enseignement de la typographie numérique et anime de nombreux colloques internationaux (Electronic publishing, Digital typography, etc.), diverses revues de recherche (dont Document numérique) et les Cahiers Gutenberg.
Cette vision informatique de la typographie l'a conduit à l’étude de l’histoire de la typographie traditionnelle dont il est aujourd'hui l'un des spécialistes français.
À ce titre, il a participé activement au XVIIIe siècle de l'Histoire de l'écriture typographique d’Yves Perrousseaux (Atelier Perrousseaux éditeur, 2010).