Le système de Robert Fludd est vaste et complet. II est éminemment matérialiste et panthéiste il exclut toute intervention volontaire d'un Dieu supérieur à la Nature, il admet la matérialité de tout de la matière d'abord et de la substance ensuite. D'après lui, la Nature, réduite à sa plus simple expression, a évolué au point de donner naissance à un Agent universel, lequel s'est subdivisé en quatre Eléments et ceux-ci en plusieurs Élémentaires. Cela fonctionne comme une immense pyramide régulière à base carrée et par analogie, tout atome, tout corps, tout système
de corps, toute partie de l'Univers et l'Univers lui même est constitué de la même façon.