Directeur de recherches à l’INRA-Clermont-Ferrand-Theix dans l’unité mixte de recherche sur les herbivores (UMR1213 Herbivores), Alain Boissy travaille sur les comportements sociaux et émotionnels des ruminants afin d’améliorer leur bien-être en élevage.
Il co-anime le réseau AgriBEA-Bien-être animal de l’INRA, groupe d'animation transversale réunissant les chercheurs intéressés par le bien-être des animaux de ferme, indépendamment de leur affiliation (Inra, CNRS, Universités, Etablissements d'enseignement agronomique et vétérinaire...