Alain Nisus est d’origine guadeloupéenne. Il a fait des études de mathématiques à Bordeaux. Il est titulaire d’une maitrise en théologie à la Faculté Libre de Théologie Évangélique (FLTE) à Vaux-sur-Seine, d’un doctorat en théologie à l’Institut Catholique de Paris, ainsi que d’une licence en philosophie à l’université de Paris VII.
Avant de devenir professeur de dogmatique à la FLTE, il a été pasteur d’une église baptiste à Versailles puis à Grenoble.
Alain Nisus a rédigé quatre articles dans le "Dictionnaire de Théologie Pratique" (autorité, cène, dons spirituels, structures d’église). Il est également l’auteur de quatre articles dans l’ouvrage "Foi chrétienne et défis du monde contemporain" (Être humain, monde invisible, racisme, sport).