Jeanne-Catherine-Agnès Arnauld, en religion Mère Agnès Arnauld, abbesse de Port-Royal, est une figure du jansénisme français.
Sœur d'Antoine Arnauld, « le Grand Arnauld » et de Mère Angélique Arnauld, elle succède à cette dernière à la tête de l'abbaye de Port-Royal des Champs de Paris en 1658. Elle dirige donc l'abbaye pendant la période la plus dure de la répression contre le jansénisme. Elle a notamment organisé le mouvement de refus de signature du Formulaire d'Alexandre VII et a été, pour cela, confrontée à l'archevêque de Paris Hardouin de Péréfixe.
Elle est également l'auteur des Constitutions de Port-Royal, texte qui règlemente la vie matérielle et spirituelle des religieuses dans un esprit de renouvellement cistercien.