Gérard Barthémémy a fait des études d'économie, il s'est ensuite orienté vers l'Anthropologie (il est enseignant à Paris VII) et l'Histoire.
Il a vécu dix-huit ans en Haïti dans le cadre d'actions de développement principalement dans le milieu rural.
Consultant international, il poursuit ses recherches sur Haïti. Il était membre du Comité de réflexion et de proposition pour les relations franco-haïtiennes, présidé par Régis Debray.
Ses principaux ouvrages, Le pays en dehors (1989) ; Dans la splendeur d’un après-midi d’histoire (1996) montrent comment Haïti après avoir réussi « sa révolte contre l’esclavage, voilà donc une masse d’anciens esclaves qui, du même coup, se met à rejeter le système à l’origine de cet esclavage et décide, sans autre idéologie que son instinct et sa phobie du passé, de s’inventer en tant que pays, en tant que culture et en tant que système économique. »
Gérard Barthémémy fut le premier époux de l'écrivaine haïtienne Mimi Barthélémy. Il est décédé en 2007.