L’explication la plus communément acceptée de ces étranges phénomènes avait trait au magnétisme. Dans le triangle des Bermudes, les aimants indiquaient parfois le « vrai nord » au lieu du « nord magnétique » utilisé pour naviguer autour de la planète. Les compas pouvaient subir des variations d’au moins vingt degrés, ce qui rendait la tâche des pilotes particulièrement ardue.