Romain Pasquier est docteur en science politique de l'université de Rennes 1. De 2000 à 2001, il a été chercheur Jean Monnet au Centre Robert Schuman de l’Institut universitaire européen de Florence. Depuis 2002, il travaille pour le Centre national de la recherche scientifique (CNRS). En 2010, il a soutenu son habilitation à diriger des recherches au Centre d'études européennes de Sciences-Po à Paris.
Chercheur invité dans plusieurs universités étrangères (Exeter, Aberystwyth, Montréal, Sevilla), Romain Pasquier est membre de l'Institut de la décentralisation et du conseil scientifique du Groupement de recherche sur l'administration locale en Europe(GRALE/CNRS
Il est également intervenant régulier dans les médias comme spécialiste des questions touchant à la décentralisation ou comme analyste de la scène politique bretonne