Le musée conserve près de 300 météorites, dont 60 en exposition, pour leur importance scientifique et historique. Parmi elles, des spécimens de la chute de météorites sur la commune de l'Aigle dans l'Orne, le 26 avril 1803, dont les habitants furent témoins. Jean-Baptiste Biot, ingénieur des Ponts et Chaussées, avait été dépêché sur place par le ministre de l'Intérieur pour étudier le phénomène. Son rapport de 1803, considéré comme l'un des textes fondateurs de la science moderne, permit de démontrer l'origine extraterrestre des météorites.