Faisant partie de la faculté de médecine de Paris Descartes, le collège a pour mission :
1. de fédérer les différents collèges d’enseignants d’immunologie des universités de langue française; 2. de représenter les enseignants d’immunologie auprès des tiers, et notamment auprès des autorités de tutelles, des instances réglementaires, des autres associations d’enseignants et des sociétés savantes; 3. de promouvoir l’enseignement et la formation continue, la recherche pédagogique et la diffusion des ressources en immunologie; 4. d'établir des liens et d’organiser des réunions entre les enseignants francophones d'immunologie de l’enseignement supérieur; 5. d'accroître la lisibilité de l'immunologie.