Denis-Michel Boël a été professeur à l'Ecole navale, au lycée de Tréguier. Il participe à la naissance du Port-musée de Douarnenez dont il a été le premier conservateur, de 1986 à 1993.
Il est ensuite inspecteur des musées de France et conseiller pour les musées martimes auprès de la Direction des musées de France au Ministère de la Culture (en 2003)
Denis-Michel Boëll a été Directeur adjoint du Musée des civilisations de l'Europe et de la Méditerranée (MuCEM) jusqu'en 2008. Il est maintenant Conservateur général au Musée de la Marine.