Joao Aguiar est né en 1943 à Lisbonne (Portugal). Après avoir suivi des études de journalisme à l'Université libre de Bruxelles, il travaille pendant quelques temps au syndicat du tourisme portugais, d'abord à Bruxelles puis Amsterdam.
Il rentre au Portugal en 1976 et entame une carrière de journaliste: il travaille pour RTP, la Radio Télévision Portugaise, et pour de nombreux quotidiens et hebdomadaires portugais, mais aussi espagnols et anglais. En 1981, il est nommé au secrétariat de la communication du ministère de la "Qualité de la Vie"... Il commence bientôt une carrière d'écrivain, avec un premier ouvrage d'étude sur "l'ésotérisme au Portugal", publié en 1983.
A ce jour, il a écrit une vingtaine de livres dont 14 romans pour adultes, traduits en Espagne, Italie et Allemagne ainsi que deux romans pour la jeunesse. En France les éditions Métailié le font connaître en ce mois de mars 2009 avec son roman noir Les mangeurs de perles dont le titre original "Os Comedores de Pérolas" a été publié en 1992 au Portugal. Joao Aguiar est devenu un auteur à temps complet, il écrit aussi des scénarios pour la télévision et le cinéma et collabore encore régulièrement à la revue "Super Interessante", (revue de vulgarisation scientifique).