Après avoir été conservateur et chargé des archives et de la bibliothèque du Musée Rodin à Paris, il est devenu successivement directeur-adjoint du Centre de recherches et responsable du programme de recherche sur les grandes fêtes du Château de Versailles.
Raphaël Masson est conservateur en chef du Patrimoine au Château de Versailles, où il est chargé de la recherche appliquée aux collections et de la conservation des théâtres.
Il a co-écrit avec Véronique Mattiussi une monographie remarquée consacrée à Auguste Rodin qui leur valut en 2005 le Prix du cercle Montherlant.
Il est également l'auteur de plusieurs ouvrages consacrés au Château de Versailles.