Après avoir étudié l'art et l'archéologie à Vienne et à Marbourg, et passé sa thèse de doctorat en 1977, Gottfried Fliedl a enseigné de 1977 à 1986 à l'Ecole Supérieure des arts appliqués de Vienne.
Entre 1990 et 2003, il a travaillé à l'Institut de recherche interdisciplinaire et de formation continue (IFF) de l'université de Vienne, entre autres comme maître de conférences en muséologie. Depuis 2004, il est directeur de la Museumakademie Joanneum à Graz.