Sextus Pompée ne retourne pas directement à Rome après sa réhabilitation. Il se rend d’abord à Massilia, au début de l’année 43. Le choix est peut-être à mettre en lien avec l’attitude anti-césarienne de la cité au début de la guerre civile, une explication largement acceptée par l’historiographie. Néanmoins, l’évaluation des raisons qui ont poussé les Massaliotes à choisir le camp de la coalition anti-césarienne en 49 n’est pas nécessairement une démarche judicieuse pour comprendre les choix politiques de la cité six années plus tard : la vie politique et ses acteurs se sont considérablement renouvelés.
Selon B. Augier, l’arrivée de Sextus Pompée à Massilia s’explique par le fait qu’« il s’agissait d’une ciuitas libera, gardant la jouissance de ses lois, coutumes et droits, qui échappait donc à la sphère de responsabilité directe du proconsul ». Ainsi, Sextus Pompée pouvait temporiser à Massilia, en terrain neutre, même s’il faut rappeler que cette « liberté » est « plus théorique que réelle » selon Chr. Goudineau, car César avait durement puni la cité4