Guy Paillotin est un ingénieur et chercheur français, qui a dirigé ou présidé divers grands organismes publics de recherche.
Guy Paillotin est polytechnicien, ancien élève de Mines ParisTech, ingénieur au corps des mines et docteur en sciences physiques de Paris XI-Orsay (1974).
Guy Paillotin a commencé sa carrière au CEA comme chercheur en biophysique (1966-1975), puis devient chef du service de biophysique au CEA (1975-1981).
Il passe au ministère de la recherche et de la technologie (1982-1983) où il organise sous la direction de Maurice Allègre un secrétariat général des programmes mobilisateurs.
De retour au CEA, il y est adjoint au chef du département biologie (1983-1984).
Il est alors nommé directeur général adjoint de l'INRA (1984-1989).
De 1991 à 1999, il préside l'INRA. Il préside en outre le CIRAD de 1992 à 1999.
Il préside aussi le conseil d'administration de l’Agence française de sécurité sanitaire de l’environnement et du travail à partir de 2002.
Il est aujourd'hui secrétaire perpétuel de l'Académie d'agriculture.
Ses travaux de recherche ont porté sur les mécanismes de base de la photosynthèse et en particulier le transport d’énergie.
Il a écrit Les aliments du futur et est l’auteur avec Dominique Rousset de l’ouvrage Tais toi et mange.