Hugues Daussy est professeur d'histoire moderne à l'Université de Franche-Comté et membre honoraire de l'Institut Universitaire de France. Il a notamment publié " Les huguenots et le roi. Le combat politique de Philippe Duplessis-Mornay (1572-1600) " (Droz, 2002), "Le parti huguenot. Chronique d'une désillusion (1557-1572)" (Droz, 2014) et "Les protestants dans la France moderne" (Belin, 2006) avec Didier Boisson.
Agrégé d'Histoire en 1994 et docteur en Histoire en 2000 et Habilité à diriger des recherches en 2011, ses recherches portent sur l’histoire du protestantisme français et européen au XVIe siècle. Après avoir consacré sa thèse au combat politique de Philippe Duplessis-Mornay, il a consacré son Habilitation à Diriger des Recherches à l’histoire du parti huguenot de ses origines à la Saint-Barthélemy (1572). Ses projets s’articulent désormais autour de deux axes principaux : la reconstitution du réseau politique et diplomatique international protestant et l'écriture d'une histoire politique de la Réforme française.