Titulaire d’un BTS en arboriculture fruitière, d’une licence ès Sciences et d’une maîtrise de Biologie végétale (Université Lyon II), il a effectué son parcours professionnel dans le domaine de la protection des cultures.
Il s'est intéressé durant près de vingt ans à la maîtrise des effets des pratiques agricoles sur l'environnement.
Il est vice-président de l'Académie d'agriculture de France.
Jean-Louis Bernard a rédigé plus de plus de 150 articles techniques et donné des centaines de conférences. Il est auteur, co-auteur ou coordinateur de plusieurs ouvrages.