En juin 1942,il est condamné à mort.
Il est fusillé a fort de Bondues le 30 mars 1943 et est enterré au cimetière de Dunkerque Il avait 43 ans.
Il a laissé un souvenir inoubliable à ceux qui l'ont connu.
L'abbé Bonpain était si bon qu'il aurait mérité de s'appeler l'abbé Brioche.