Après une thèse de sciences, réalisée à l’Institut Pasteur, dans le laboratoire de François Jacob et consacrée à la mise au point d’un vecteur rétroviral chez la souris, Pascal Nouvel entreprend une thèse de philosophie consacrée au rôle de l’imagination dans la création scientifique. .
Après cette seconde thèse, il est nommé sur un poste de Maître de Conférences en philosophie des sciences à l’université Paris-Diderot (Paris 7) avant d’être nommé Professeur de philosophie à l’université Paul Valéry de Montpellier où il enseigne actuellement.
Il s’intéresse principalement à l’évolution des sciences du vivant (biologie et médecine) et aux implications philosophiques, éthiques, sociales et politiques de cette évolution. Après avoir publié plusieurs livres et articles sur l’œuvre de Gaston Bachelard, il a publié un important travail sur la psychologie scientifique.
Ses travaux s’orientent de plus en plus nettement vers le rôle des affects, des émotions et des passions dans la connaissance.Cet intérêt est conduit tant à travers un examen des philosophies qui se sont particulièrement intéressés aux affects (les Stoïciens, Spinoza, Hume, Schopenhauer, Nietzsche) qu’à travers une approche plus personnelle développée dans un essai sur la passion amoureuse : Conversation avec mon clone sur la passion amoureuse. Il porte intérêt aux substances chimiques qui ont la propriété d’altérer ou de modifier la vie affective et émotive et, d’une façon générale, aux substances psychotropes.