Après des études universitaires au Japon une licence et une maîtrise à l'université Paris-IV, Keiko OMOTO est en charge des fonds Japonais de la bibliothèque du musée national des Arts asiatiques Guimet.
Intéressée par les rapports franco-japonais, elle a publié les premières études relatives au voyage d’Émile Guimet et de Félix Régamey au Japon.