Jeannine Auboyer fit ses études à l'Ecole du Louvre et à l'Ecole Pratique des Hautes Etudes. En 1931 elle fut chargée de mission au Musée Indochinois. De 1936 à 1942 elle sera chargée de mission à Guimet, puis de 1942 à 1946 attachée titulaire au musée Cernuschi, puis de nouveau à Guimet qu'elle devait diriger de 1965 à 1980.