Polytechnicien, enarque, Didier Tabuteau est Conseiller d'État. Il est l'actuel responsable de la Chaire Santé de Sciences politiques (Paris).
Il a dirigé le cabinet de Bernard Kouchner au Ministère de la Santé de 1992 à 1993 et de 2001 à 2002. Il a également été directeur adjoint du cabinet du Ministère des Affaires Sociales, avec Claude Évin (de 1988 à 1991) et avec Martine Aubry (de 1997 à 2000). À la création de l'Agence du médicament (actuelle Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé) en 1993 il en fut le directeur-général jusqu'en 1997.
Il a été chargé de la préparation de la loi sur les droits des malades en 2000 (Loi du 4 mars 2002 relative aux droits des malades et à la qualité du système de santé).