Questions-Réponses

Belle question, bien formulée. Au-delà des essais polémiques et salubres de réhabilitation (je citerais aussi celui de Régine Pernoud, Pour en finir avec le Moyen Age ), je vous suggère de regarder les livres consacrés à la naissance des états médiévaux  à partir des royaumes barbares : en particulier, le très bon essai de Bruno Dumézil, Les racines chrétiennes de l`Europe : Conversion et liberté ...  et sa vie de la reine Brunehaut, La reine Brunehaut  . Un livre dont on parle peu, de Marguerite Boulet-Sautel, Vivre au royaume de France aux PUF, et l'étude ponctuelle, mais si éclairante, de Laurent Feller, L`assassinat de Charles le Bon, comte de Flandre   évoquent le Moyen Age "classique", avec le magnifique Saint-Louis   de Jacques Le Goff. Enfin, les éditions Belin ont publié trois volumes importants sur le Moyen-Age : La France avant la France (481-888)   L`Age d`or capetien (1180-1328)   et Le temps de la guerre de Cent Ans, 1328-1453  
En ce qui concerne les chrétiens orientaux, pour le Moyen-Age on ne peut éviter de parler de l'empire romain d'Orient, ou byzantin. Mais il est en soi un thème de bibliographie. En France,  la question culturelle byzantine est peu traitée (et pour cause, quand on voit ce qui est arrivé à Sylvain Gouguenheim) : il faut citer le livre essentiel du Grec Anthony Kaldellis, Hellenism in Byzantium   ou bien, en français, un petit essai très éclairant de Guglielmo Cavallo, Lire à Byzance  
Il y en a mille autres ...

Un ouvrage sur l'histoire religieuse occidentale, plutôt exhaustif bien que n'embrassant pas le sujet en profondeur: Histoire religieuse de l'Occident médiéval, de Jean Chélini. Concernant Aristote à la fin de cette période, il y a un ouvrage qui commence à dater mais reste plutôt pertinent: Vérités dissonantes: Aristote à la fin du Moyen Âge, par Luca Bianchi et Eugenio Randi. le sujet de l'apport (ou du non-apport) islamique à la philosophie européenne par la transmission d'Aristote est extrêmement polémique depuis le livre de Gouguenheim et à ma connaissance, aucun travail sérieux n'a été mené sur ce sujet depuis, en tout cas en langue française, les universitaires français goûtant peu les remises en question de leur historiographie... Même à l'étranger, je ne vois aucun livre à vous conseiller pour soutenir la thèse de Gouguenheim.
Bon courage et bonne lecture :)

si votre question reste d'actualité en 2020 je vous orienterai vers la série Le Seigneur de Châlus - Saga des Limousins  sur l'an mil (et suivants) en Europe vu au travers d'une famille fictive de limousins qui vont parcourir l’Europe et dont les membres vont œuvrer dans des domaines divers (porcelaine bien sur, médecine, forge,...etc) et rencontrer des personnages réels et vivre des événements marquants de l'époque. Romancé mais sur de solides bases de connaissance avec en fin de volume les précisions de l'auteur sur la véracité historiques et les libertés prises avec les connaissances...