Agrégée d'Histoire, Marie-Anne Matard-Bonucci a été élève à l’Ecole Normale Supérieure ainsi que de l’Ecole française de Rome. Sa thèse a pour sujet l’histoire du fascisme en Sicile, permettant la publication de son premier livre, en 1994 : "Histoire de la Mafia. Marie-Anne Matard-Bonucci participe activement à différents centres de recherche ; elle est notamment chercheuse au centre d’Histoire de science politique, et co-dirige le GRIC (Groupe de Recherche sur l’Italie Contemporaine). C’est tout naturellement qu’elle se joint à Marc Lazar, autre spécialiste de la politique italienne contemporaine, pour diriger l’ouvrage ‘L’Italie des années de plomb" (2010). L’un des autres thèmes majeurs du travail de Marie-Anne Matard-Bonucci est également la question de l’antisémitisme en France et en Italie au XXe siècle. Elle a déjà publié différents livres sur le sujet, comme "L’Italie fasciste et la persécution des juifs"