Le major Motoko Kusanagi, cyborg, responsable de la section 9 mène la traque contre un cybercriminel, le "marionnettiste", prenant le contrôle de l'esprit d'autre humain par l'intermédiaire du réseau numérique mondial.
Pilier du manga cyberpunk et de science fiction à l'esthétique très détaillé et inspirant dans son style,
Masamune Shirow pose de nombreuses questions du transhumanisme., l'âme et l'être humain.